奥之院留有四棵日莲圣人亲手种植的杉树，被登记为身延町指定文化财产。据说是圣人为了向父母和恩师道善坊的迫善报恩，以及祈祷立正安国而种植的。攀登从开基堂前往仁王门的台阶时，台阶右边是“御父妙日尊仪菩提之杉”，左边是“御母妙莲尊尼菩提之杉”。台阶左侧的树丛中伫立着“立正安国祈念之杉”，院内右侧则是“御师范道善坊报恩之杉”。每棵杉树都是树龄超过700年的巨木。