本阵原本指的是军中大将在营地里的位置，但是战国时代后也被用来指代大名和朝臣等住宿和休息的设施。江户时代大名按照轮流晋谒制往返江户时留宿本阵。
石和宿在宽永年间1625年左右奉幕府之命建造本阵。此外也有说法是1761（宝历11）年，信州高远城主内藤大和守因轮流晋谒，第一次途经甲州道路时命令石和宿仲町的后藤勘兵卫建造了本阵。根据后藤家的资料记载，截止1835（天保5）年为止的164年间，石和宿的本阵共留宿过174名大名、朝臣、官吏。
这里曾是一座壮观的书院构造的建筑，但在1880（明治13）年6月明治天皇预定巡幸留宿前，因一场大火被毁，只有一栋仓库留存。石和本阵遗址被指定为石和町的文化财产。