武田信玄选定的“甲府五山”之一，是五寺中位列第一的寺院。作为信玄之母大井夫人墓所在菩提寺而闻名，内有被指定为日本国家重要文化财产的“武田信虎夫人像”（大井夫人肖像画）。
这里也是武田信玄学禅的寺院，长禅寺开基时的住持岐秀元伯是大井夫人在信玄幼年时期为他选的教授学问和政道的老师。据说他对信玄的性格养成有重大影响，是一位著名的高僧，武田晴信赐予其“机山信玄”的法号。寺门宽大且有厚重感，院内除了正殿外，还有三重塔和五重塔。