仏殿は1708（宝永5）年に建立されて以来、火事や地震などの天災で幾度となく失われ、そのたびに再建されてきました。現在の建物は日蓮聖人650遠忌を記念して1931（昭和6）年に建立されたものです。仏殿の左右後ろには納牌堂も備えられ、全国の信者が久遠寺に納めた分骨や位牌が安置されています。